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文章发表:Using meshes for MeSH term enrichment and semantic analysesYuLab软件开发关于多序列比对可视化,我们做了一个包助力微生物组学分析--实验室新R包MicrobiotaProcess

aplot包:让你画出更复杂的图你的页面还少了一点装逼的徽章听说你装不了github的包?aplot拼图?我掐指一算,发现事情没那么简单!ChIPseekerCS0: ChIPseq从入门到放弃CS1: ChIPseq简介

CS2: BED文件CS3: peak注释CS4:关于ChIPseq注释的几个问题CS5: 吃着火锅,唱着歌,还把分析给做了CS6: ChIPseeker的可视化方法CS7:Genomic coordination的富集性分析(1)

CS8:Genomic coordination的富集性分析(2)CS9: GEO数据挖掘CS10: 八卦终结版CS番外1:如何定义下游的区间?CS番外2: 过滤ChIPseeker注释结果CS番外3:更好用,更稳定的upsetplot + vennpie

CS番外4:自定义注释分类ChIPseeker其实支持顺反组的各种测序数据clusterProfilerclusterProfiler for enrichment analysiswhy clusterProfiler fails

为什么画出来的点比指定的数目要多?DAVID分析结果转为enrichResultDAVID functional analysis with clusterProfilerenrichDAVID支持自定义背景

SCIENCE文章用了DAVID被吐槽Comparison of clusterProfiler and GSEA-P听说你有RNAseq数据却不知道怎么跑GSEAleading edge analysis

单篇引用超过500了,来了解一下use clusterProfiler as an universal enrichment analysis tool功能注释后如何做富集分msigdf + clusterProfiler全方位支持MSigDb

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富集分析事后丸:过滤数据用dplyr动词操作富集分析结果clusterProfiler优化: 以更快的速度进行GO分析和GMT文件解析使用clusterProfiler对非模式植物进行注释GObuildGOmap

非模式基因GO富集分析:以玉米为例+使用OrgDbenrichGO出不来结果?没结果也是正确的结果GO analysis using clusterProfileruse simplify to remove redundancy of enriched GO terms

GO富集分析中的间接注释靠树树会倒,不要太相信你的注释文件!KEGGko数据库ID转换听说你的KEGG分析有大量的基因没注释水稻如何做KEGG富集分析使用新姿势玩KEGG,是种什么体验...利用KEGG数据库进行ID转换

KEGG Module Enrichment Analysis如何利用clusterProfiler获取最新的KEGG和基因对应关系KEGG数据本地化,再也不用担心网络问题了多物种批量下载KEGG数据并做成KEGG.db包

DOSE搞大你的点,让我们画真正的气泡图听说你也在画dotplot,但是我不服!dotplot展示富集分析结果dotplot for GSEAenrichment mapjoyplot:GSEA的结果也能快乐起来

gseaplot自定义颜色DOSE包引用过百还想用clusterProfiler以前的那些画图函数,怎么办?emojifont看完此文, 你也能够大开脑洞, 上升逼格emojifont包画❤️装geek什么的,都弱爆了!

emojifont新功能(有视频哦)phylomoji:用emoji画进化树你所没见过的苹果画图讲故事听说你也有 emojifont 的字体使用困惑enrichplotenrichplot: 让你们对clusterProfiler系列包无法自拔

安装enrichplot及升级clusterProfilerdotplot支持使用formula指定x轴变量一样的函数,不一样的upsetcnetplot只标注部分节点的label多组数据富集分析结果可视化

多出来的点是猴子变的吗?所有人都在做富集,但没人在意它的结果ggimageggimage:ggplot2中愉快地使用图片geom_pokemon: 使用pokemon画图大开眼界+多图慎点:Pokémon x NBA and other fun with ggimage

你的专业是那一只Pokémon神兽?纯代码生成banner我的名字和我的姓氏正经的图千篇一律,不正经的叔万里挑一饼图版气泡图转发5个群,Y叔送你一顶帽子用图片当ggplot2画布2018世界杯专属图层每周一图之粉丝来袭~

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ggplot2版本的 --> 耗子尾汁gglayer130岁了,祝你生快画个小圈圈ggplotifyggsave支持base plot转UpSet图为ggplot?ggplotify简史听说你想把pheatmap和ggplot2拼在一起

ggplotify - version 0.0.4听说你想把Gviz画的基因结构转成ggplot?ggtreeAsk me anything about ggtree当年ggtree发布文,为整合数据而生!

ggtree无根树及注释无根树中加入枝长图例ggtree画根分支phylip树格式ggtree版本的plotTreealign genomic features with phylogenetic tree

ggjoy facet with ggtreereproducible logo generated by ggtree用ggtree重现Figtree的示例进化树ggtree for microbiome data

ggtree for outbreak dataggtree支持phylog对象ggtree画层次聚类用户数据注释进化树改变outgroup的枝长使用自己的数据来给进化树上色bootstrap分段标记ggtree中标记树分支?

xlim_tree: set x axis limits for only Tree panelreverse time scalevertical dendrogram in ggtree中空的环形树

可视化操作树的拓扑结构ggtree - updating a tree viewfacet_plot: 加图层到特定的分面上facet_plot:加图层到特定分面,方法二facet_plot: 关联数据和进化树的通用方法

facet_plot更改panel label同时让N颗树关联同一个数据集漫画版的进化树你见过吗?取子集画图Y叔不想养蛙,只想养你!用图片注释进化树当生物女博士遇到小学二年级语文作业identify: 交互式操作进化树

plotly: 交互式探索进化树ggnetworx:让ggtree支持phylogenetic networksggtree买家秀ggplot2 - 更改分面的相对宽度听说你想画好几颗树在一起倒不如画一些渐变色的线条吧

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一个legend伪装成三个,服气!听说你想给线条画个边框?ggtreeExtra用图层叠加方法绘制环形进化树直播webinar录播 (2017-10-24):plotting tree + dataggtree直播PPT第一部分

ggtree直播PPT第二部分GOSemSimGOSemSim: 跨物种计算基因相似性GOSemSim:GO语义相似性度量基因或蛋白之间,谁是谁的死党?GOSemSim又高被引了!hexStickerggtree hex sticker

ggtree hexbin sticker投票结果一大波贴纸来袭就是这么简单,你也能够纯代码生成六角贴!2018年useR会议的一道风景线meme用R画meme ;)使用外部字体画meme扪心自问,meme几何?

答: 扪心自问,meme几何?meshesusing meshes for MeSH Enrichment AnalysisReactomePAReactomePA引用过百rvcheck一键更新所有R包

RStudio Server一键打开服务器端的文件scatterpiescatterpie:离散饼图邪恶的我画出了善良的饼图scholar一个要复活的R包和一个404的网站自动抓取论文的引用数据scholar包检索期刊影响因子

seqcomboDNA序列重组可视化方法seqcombo画地图的需求?shadowtext带你装逼带你飞,画图的文本打出阴影立体效果制作meme的通用方式,来了解一下让你的ggplot2坐标轴文本也出现阴影效果

tidytree给进化树加分支treeio树变图,图变树?treeio: 进化树基础类和方法进化树改名treeio: Phylogenetic data integrationSubsetting Phylogenetic Trees

treeio支持解析MEGA的输出yyplotY叔的新玩意--yyplot一次解决ggplot2所有字体映射变量给axis上色pubmed年度趋势,你的开题报告需要它!ggplot扩展学习笔记--逐行解析Y叔的"geom_ord_ellipse.R"

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用Dash做一个新冠疫情监测仪表板(dashboard)一个监测各省市新冠状病毒疫情的网站用shiny和echarts4r制作一个COVID-19的dashboard倒不如用R画个新冠病毒吧...统计Five things biologists should know about statistics

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s08 - RNA Splicings09 - Perfect Matchings and RNA Secondary Structures算法用动态规划实现全局序列比对Support Vector Machine

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安装os9和netbsd双系统Edit partition table in NetBSD/macppcWindowsXming-windows下远程linux桌面Windows远程及本地运行Linux的GUI程序

你是我的巧克力 - Windows包管理器ChocolateyEmacs中使用R,开箱即用版本C++金银岛航线利用多边形估计Pi值Neumann的随机数生成器Linear Congruential Generator

手上握有多少幸运票?斐波那契数列二叉搜索求函数值用链表解决约瑟夫问题Y叔生活篇匆匆那年,如一场不真实的梦我在MSnbase里做了什么?来香港读博其实是被逼的假期如何假装我们还在工作?博士养成记Y叔要求职。

再见,HKU你好南医大 & 教师节快乐!丹麦压马路黑灯瞎火 - 哥本哈根巴黎压马路那一年,那一场,本属于我的生信处女show,好像从来没有发生过一样!这些年,我上过的课(是上过,不是被上)那些我讲过的oral

剑桥膜拜大神记听说我的包用的人还挺多!国庆去哪玩?办公室里写课件!!!2020|南方医科大学基础医学院生物信息学专业招生宣传为了忘却的纪念——我在港大把导师给炒了硕博士的那点事博士版2048,不服来战!

滚吧,骚年扫盲贴:博士学位知多少给硕博考生的一封信牛逼的博士论文,标题只有两个字符!#聚众读博# Y叔招生信方向的硕士、博士、博士后你弱你有理,我还惹不起你还在愁毕业?隔壁实验室的小哥从网上抄了几十行代码打了个R包,发了SCI,毕业了!

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[连载2]:Editor你的心不会痛吗?[连载3]:辣眼睛,一篇抄袭引发的系列血案![连载4]:我像是一颗棋,进退任由你决定从业超过10年,未见过如此厚颜无耻之人活久见,抄袭竟是重用他人代码没有致谢?祝你们缠缠绵绵到天涯

大学教授力挺抄袭,强行洗地到裤衩都不要了,到底图什么?关于重用代码与文章抄袭虐狗节来看一下这个裤衩都不要的故事虽然撤稿了,但足以令人心寒!贵圈真乱biobabble公众号怀疑人生!我不欠你们钱,好吗?为我们的塑料友谊干杯

为什么要开这个公众号关于《关于转载》公众号「biobabble」是什么意思?真爱是什么?爱要高声喊出来谁是确认过眼神的人?微信公众文 -- markdown一键排版公号狗的福音这么巧啊,你也在研究那坨屎!

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百二秦关终属楚好饿,连刚需都解决不了的医学院野猪通缉画像用ggplot写一个「囧」字吧你好,2019元素周期表年小海龟告诉你【啥是佩奇】3D版邪恶的曲线一图告诉你venn plot和upset plot的关系

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与导师的初次见面相亲套路深别人家的学生选导师要了解人品今天放过论文,对自己好一点老年博士生的悲哀抄袭代码抄出了版权excel大坑python版的dplyr: siuba包一直重启一直爽clusterProfiler通用模式

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一千个伤心的理由轮到相思没处辞,眉间露一丝不为无益之事 何以遣有涯之生你所在的地区因为版权问题播放不了音乐怎么破?王八拳编程及其它宋词-词频你是否还在用那些该退出历史舞台的软件?学会生信,只需三天!你是最棒的!(手动滑稽)

生信到底是学R还是python?996.ICU520交出什么比较好?玩转office只需要这一招不上少儿编程课,生物妈在生活中训练编程思维在广州多少钱能拍一个车牌用R鸣响三分钟志哀

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